Врач не обязан проводить подобные манипуляции (приготовление препаратов к введению) в присутствии пациента, однако обязан фиксировать все лечебные манипуляции (в т.ч. и введение БЦЖ) в медицинской документации. Дабы избежать недопонимания лучше обсудить это с врачом, если ответы Вас не удовлетворят - можете просить передать Вас другому доктору.